洋第三镇也从袁世凯手里挖了过来，但袁世凯仍然控制着4个镇，清廷依然还是对他不能放心。这次趁着袁世凯去南方，在朝中就有不少人打算对北洋新军动手，虽然袁世凯要求带2个镇南下，但毕竞还是留下了两个镇，如果清廷能够将这两个镇也挖过来，这样朝廷就控制北洋新军的4个镇，也就彻底解除了袁世凯的兵权了。而袁世凯要求从湖北新军中抽调一部份兵力，清廷也同意将湖北新军的1个协调给袁世凯部，也算是答应了袁世凯的要求。
其实清廷的这些打算，袁世凯心里都清楚，他要求带2个镇南下，也是经过了认真的计算，再要多了清廷也不会批，而自己一走，清廷也肯定会对下来的两个镇下手，不过袁世凯也另有自己的打算，尽管明面上只要了两个镇，但在出发的时候，袁世凯打算从剩下的两个镇中各抽调1个协，这样实际是带了3个镇的军队南下，再加上湖北新军的1个协，袁世凯手里掌握的兵力2个镇3个协，共计约4万余人，这样的兵力也是相当可观的。
另外袁世凯也计划好，一但到了南方，就以3个协为基础，招募新兵，再扩编成3个镇，这样最多也就是在1年之后，自己就可以再度掌握5个镇的军队，在南方来说，绝对是最强的军力。
而对袁世凯推荐徐世昌为军机大臣，清廷经过商议之后，决定晋升徐世昌为户部尚书，但没有选入军机处。原因是徐世昌的资历实在是太浅了，而且由侍郎入选军机，也未免太快，徐世昌虽然有些能力，但毕竟没有立下什么大功，即使入选军机，也难以服众，因此晋升为户部尚书，就算是看着袁世凯的面子了。
其实袁世凯也知道，清廷不可能任命徐世昌为军机大臣，之所以这样推荐，还是向清廷漫天要价，而户部尚书己经达到了他的预期，毕竞徐世昌确实是资历不足，就是被选入军机也起不了多大的作用，还不如先在户部尚书的位置上多历练几年，当然如果清廷能够撑到那个时候，而清廷撑不到那个时候，徐世昌大可以绕道南下，到两江来找自己，协助自己在
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