首先是十月二十二日这天，足利义昭离开御所到洛北一处寺庙会客，正午在野外休憩时，忽然遭到一伙数十人“悍匪”的袭击。当时将军身边护卫不足百数，其中还包括了过半华而不实的仪仗人员，局势一度显得十分凶恶。
但碰巧，明智光秀正在队中，他的侄子，外号“鬼武者”的明智左马介秀满又一贯与之形影不离。这“鬼武者”挥刀接连讨取一十二具敌方首级，令护卫队士气大振，配合匆匆赶到的警备队伍，将刺杀者一网打尽。
然后，悍匪尽皆死战不降，全数伏诛。事后清点，共有五十三名刺客，其中至少二十人经过尸首辨认，可以确定是幕府内部有头有脸的人物。官方怀疑此事与被称为“义辉公遗孤”的“武辉丸公子”有关。
事后足利义昭大为震动，立即决定中止会客，提前折返。
一天之后，十月二十三日，回到御所，竟然遇到有四十名中下级家臣聚集在御所门口，冒着严寒跪倒在冰天雪地，半是示威，半是劝谏，要求公方大人收养年仅八岁的武辉丸做养子，并册立为世嗣，继承将军之位。
对此足利义昭是怒发冲冠，断然拒绝，丝毫没给出商量余地，并且说出前一日遭受刺杀的事情，怀疑这些请愿者与刺杀者是同一伙人，说他们“狼子野心，目无法纪”。
四十名请愿群众听说了“刺杀事件”后尽皆大惊，而后反应各异。
有十几人当即抽出匕首切腹自尽，绝望地证明清白。
也有十几人感到无颜，悄然退去，消失在街角。
少数几个坚持不肯退去的，到晚上都被收押监禁。
不管怎么说，事情是闹得京都人尽皆知了。
又过两天，十月二十五日，足利义昭宣布武辉丸乃叛党领袖，绝不可饶恕，同时命令幕府上下所有家臣集中在御所召开会议。然后却见到多人缺席，同时一名僧人被委托带来了书信，乃是数十人联名书信的“辞状”，包括足利谱代的大馆义实、甚有良才之名的沼田佑光
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