这次闭塞作战就显得犹为关建了。
不过联合舰队也对这次闭塞作战下足了工夫，充份吸取了前两次闭塞战的经验，仅闭塞船的数量达到了12只，过了前两次闭塞船的数量，并且还专门研究出了一个“四三三二” 闭塞作战队形，由参加过前两次闭塞作战的斋藤七五郎大尉为监督进行训练，因此联合舰队上下对这次闭塞作战也充满了信心，志在必得。
但事与愿违，第三次闭塞作战从一开始就不顺，先是在出之后，闭塞船釜山丸的动机出了问题，尽管釜山丸的指挥官大角岑生大尉坚持要参加战斗，但由于航不足而渐渐掉队，最后动机彻底坏掉，只能停在海洋岛。
5月2日晚上9点，闭塞作战开始，但这时天气变得恶劣起来，海面上刮起了猛烈的大风，11艘闭塞船无法保持队列，
这时新田丸上的闭塞作战总指挥，林中佐考虑到这种海况天气，并不利于作战，于是决定中止作战，下令闭塞船队回航，但这时闭塞船队的队形己乱，结果仅有小仓丸、长门丸两艘船看到了信号，随新田丸转向回航，而其余8艘闭塞船在风浪中分成两队，仍然向旅顺港驶去。
而在旅顺，马卡洛夫战死后，在新任司令斯科尔伊多夫到任前，暂时由阿列克谢耶夫代行舰队司令职务，马卡洛夫上任的时间虽然不长，但毕竟给旅顺港打造了一个完善的防御体系，而阿列克谢耶夫的才能尽管远不及马卡洛夫，但也不是笨人，完全继承了马卡洛夫打造的防御体系，并且还在港内布下了防雷网，也同样在港外布设*，使旅顺港的防御更为严密。
结果闭塞船队在外港遭到了俄军猛烈的炮火打击，8艘闭塞船要么是被炮火击沉，要么是无法突进而被迫引爆自沉，最终没有一艘能够在预定位置沉没。
第三次闭塞战作战规模和损失均比前两次大很多，突入港口的八艘船共有158人，最后的生还的只有63人，其中有两艘船的人员全部阵亡。后来日本攻下旅顺之后，又找到了16名幸存者，并在俄国墓地找到了3
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