随后，河合操大将就在指挥部内切腹自尽了。指挥部内的其他日军军官，也大都切腹自尽了，少部分的人，选择了向帝国6军投降。
同样的，寺内正毅首相，也选择了在首相府的地下室切腹。
在这样的情况之下，日军更是失去了指挥，只能够各自为战。面对帝国6军的猛烈进攻，他们更是没有抵抗之力。在11月8日这一天，整个东京就陷落了，完全被帝国6军给占领了。
东京虽然陷落了，标志着日本在这一场战争当中彻底被打败了。但是，这并不代表战斗就结束了。东京北面本州岛北部区域，还有十几个日军师团正在顽抗。尽管，在石本新六大将和河合操大将下令他们增援东京的时候，他们选择了拒绝。但是，这并不代表他们就会臣服了。
大正天皇已经成为了帝国6军手中的一个极好的底牌了。帝国6军让西园寺公望等人，派人带着大正天皇的手书，前去让那些将领们放弃抵抗，向帝国6军投降。如果拒绝投降，顽抗的话，帝国6军将对他们发起猛烈的进攻。
绝大部分的日军将领都意识到了，现在已经是大势已去了。如果想要活命的话，那就唯有向帝国6军投降一个选择。特别是帝国6军向他们保证，只要今后选择向帝国臣服的话，不仅可以保证他们的生命安全。甚至，在未来日本的新政府内，还会有他们的一席之地之后，绝大部分的日军将领都选择了投降，这无疑是正确无比的选择。
当然，负隅顽抗的人也不是没有。只是，在面对帝国6军的主力部队的进攻的情况下，这些日军根本就抵抗不了多久就被消灭了。
另外，那些被打散了的日军以及日本民众组成的抵抗势力，也都纷纷接到了日本大正天皇的命令。在大正天皇的命令之下，他们中的绝大部分人，同样是选择了投降。只有少部分人，在山区继续抵抗。不过，他们也将面临帝国6军，朝鲜军队以及后来建立的日本保安部队的围剿。在残酷的围剿之下，这些日本抵抗势力，根本就翻不起什么风
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